過氧乙酸消毒劑是一種強氧化劑，為無色液體，有強烈刺激性氣味，具有酸性腐蝕性，必須稀釋後使用。

過氧乙酸可分解為乙酸、氧氣，與還原劑、有機物等接觸會發生劇烈反應，有燃燒爆炸的危險。

臨床醫學上，過氧乙酸水溶液可用以對物塊表層、皮膚、黏膜、餐具、蔬菜水果、新鮮水果、自然環境的消毒殺菌。依據臨床醫學認證說明，過氧乙酸水溶液的使用方法使用量是黏膜消毒殺菌用0.02%濃度值，皮膚和環境汙染的物件表層、水果蔬菜等消毒殺菌用0.2%濃度值，1.5%水溶液可用以廚具、紡織物、電子溫度計等的侵泡消毒殺菌。噴霧器或加溫揮發蒸熏用以環境消毒，日用量1～3g/m3（按過氧乙酸計）。

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